Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVI0

PHF20, PHD finger protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20Q9BVI0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF20Q9BVI0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms