Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS4Q9BT78 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms