Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY3Q9BT09 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPY3Q9BT09 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms