Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM29Q9BSF4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms