Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM175Q9BSA9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms