Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPKQ9BS16 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPKQ9BS16 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms