Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BPIFA3Q9BQP9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms