Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGIP1Q9BQI5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms