Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USB1Q9BQ65 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USB1Q9BQ65 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms