Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF15Q99988 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF15Q99988 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms