Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms