Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYD88Q99836 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms