Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSG101Q99816 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms