Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX2Q99697 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PITX2Q99697 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX2Q99697 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms