Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF18Q99633 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF18Q99633 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF18Q99633 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF18Q99633 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF18Q99633 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF18Q99633 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF18Q99633 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF18Q99633 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF18Q99633 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF18Q99633 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF18Q99633 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF18Q99633 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF18Q99633 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF18Q99633 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF18Q99633 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF18Q99633 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF18Q99633 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF18Q99633 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF18Q99633 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF18Q99633 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF18Q99633 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF18Q99633 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF18Q99633 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF18Q99633 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF18Q99633 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF18Q99633 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF18Q99633 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF18Q99633 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms