Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS8Q99627 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms