Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms