Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY1Q96T51 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms