Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CICQ96RK0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CICQ96RK0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms