Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC38A2Q96QD8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms