Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMAQ96QA5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMAQ96QA5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMAQ96QA5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMAQ96QA5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMAQ96QA5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMAQ96QA5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms