Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNGAP1Q96PV0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNGAP1Q96PV0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNGAP1Q96PV0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms