Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK3Q96PN8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK3Q96PN8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms