Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ARAP1Q96P48 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 412.2 ms