Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX3Q96JJ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms