Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG1Q96JA1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms