Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZC2HC1AQ96GY0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms