Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APIPQ96GX9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms