Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms