Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN17Q96FV3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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