Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC3Q96F86 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC3Q96F86 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC3Q96F86 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC3Q96F86 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC3Q96F86 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC3Q96F86 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC3Q96F86 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC3Q96F86 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC3Q96F86 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDC3Q96F86 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms