Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHFRQ96EP1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms