Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms