Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SPACA9Q96E40 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPACA9Q96E40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms