Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OPTNQ96CV9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms