Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1AQ96CP6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRAMD1AQ96CP6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1AQ96CP6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms