Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB7BQ96AH8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB7BQ96AH8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms