Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX4Q969G2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms