Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCC1Q92922 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCC1Q92922 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMARCC1Q92922 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms