Protein–RNA interactions for Protein: Q92888

ARHGEF1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1Q92888 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF1Q92888 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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ARHGEF1Q92888 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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ARHGEF1Q92888 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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ARHGEF1Q92888 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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ARHGEF1Q92888 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARHGEF1Q92888 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF1Q92888 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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