Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4BQ92750 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4BQ92750 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms