Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms