Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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COPS9Q8WXC6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS9Q8WXC6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS9Q8WXC6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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