Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE2Q8WWL2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPIRE2Q8WWL2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms