Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C7orf43Q8WVR3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C7orf43Q8WVR3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C7orf43Q8WVR3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C7orf43Q8WVR3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C7orf43Q8WVR3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
C7orf43Q8WVR3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
C7orf43Q8WVR3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C7orf43Q8WVR3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C7orf43Q8WVR3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms