Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
TRIM41Q8WV44 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TRIM41Q8WV44 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms