Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP61Q8NHU2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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