Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST2Q8NFU1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BEST2Q8NFU1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEST2Q8NFU1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms