Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIEQ8NEW7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
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