Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM199Q8N511 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM199Q8N511 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms